Chociaż księgowość internetowa posiada ogromną ilość walorów i mocnych stron, to wyróżnić będziemy potrafili także trochę tych słabszych, o których warto napomknąć, by mieć dokładny pogląd na sposób jej działania i wykorzystanie w praktyce.
Po pierwsze, musisz wiedzieć, że w wypadku rachunkowości internetowej, wszystkie operacje do systemu wprowadzasz osobiście, lub wykonuje je pracownik. W momencie, kiedy zadanie ma je wykonać biuro rachunkowe, wtedy jest ono obowiązkowo ubezpieczone, właśnie ze względu na szansę wystąpienia jakichkolwiek błędów. Księgowość internetowa w omawianej postaci, to natomiast aplikacje internetowe, które będą kalkulowały wprowadzane do nich informacje i na ich podstawie przygotowywały ewidencje, deklaracje i tak dalej. W momencie, gdyby system w pewnym momencie zawiódł, wina i tak leży po stronie biznesmena – księgowość internetowa jest tutaj tylko i jedynie narzędziem, z jakiego się korzysta.